Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL2P13500 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL2P13500 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL2P13500 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL2P13500 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL2P13500 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL2P13500 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL2P13500 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL2P13500 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL2P13500 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL2P13500 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL2P13500 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL2P13500 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL2P13500 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL2P13500 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL2P13500 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL2P13500 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL2P13500 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL2P13500 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL2P13500 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL2P13500 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL2P13500 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL2P13500 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL2P13500 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL2P13500 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL2P13500 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL2P13500 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL2P13500 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL2P13500 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL2P13500 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL2P13500 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL2P13500 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL2P13500 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL2P13500 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL2P13500 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL2P13500 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL2P13500 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL2P13500 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL2P13500 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL2P13500 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL2P13500 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL2P13500 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL2P13500 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL2P13500 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL2P13500 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL2P13500 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL2P13500 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL2P13500 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL2P13500 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL2P13500 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL2P13500 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL2P13500 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL2P13500 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL2P13500 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL2P13500 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL2P13500 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL2P13500 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL2P13500 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL2P13500 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL2P13500 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL2P13500 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL2P13500 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL2P13500 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL2P13500 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL2P13500 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL2P13500 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL2P13500 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL2P13500 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL2P13500 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL2P13500 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL2P13500 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL2P13500 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL2P13500 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL2P13500 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL2P13500 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL2P13500 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL2P13500 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL2P13500 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL2P13500 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL2P13500 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL2P13500 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL2P13500 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL2P13500 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL2P13500 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL2P13500 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL2P13500 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCL2P13500 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCL2P13500 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCL2P13500 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL2P13500 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL2P13500 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL2P13500 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL2P13500 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL2P13500 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL2P13500 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL2P13500 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL2P13500 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL2P13500 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL2P13500 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL2P13500 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms