Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms