Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms