Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RD3LP0DJH9 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RD3LP0DJH9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RD3LP0DJH9 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RD3LP0DJH9 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RD3LP0DJH9 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RD3LP0DJH9 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RD3LP0DJH9 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RD3LP0DJH9 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RD3LP0DJH9 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RD3LP0DJH9 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RD3LP0DJH9 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RD3LP0DJH9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RD3LP0DJH9 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RD3LP0DJH9 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RD3LP0DJH9 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RD3LP0DJH9 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RD3LP0DJH9 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RD3LP0DJH9 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RD3LP0DJH9 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
RD3LP0DJH9 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RD3LP0DJH9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms