Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms