Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJB1P08034 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJB1P08034 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GJB1P08034 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GJB1P08034 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJB1P08034 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJB1P08034 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJB1P08034 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJB1P08034 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJB1P08034 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB1P08034 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB1P08034 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB1P08034 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB1P08034 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB1P08034 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB1P08034 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB1P08034 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB1P08034 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB1P08034 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB1P08034 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB1P08034 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB1P08034 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB1P08034 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB1P08034 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB1P08034 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB1P08034 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB1P08034 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB1P08034 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB1P08034 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB1P08034 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB1P08034 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB1P08034 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB1P08034 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB1P08034 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB1P08034 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB1P08034 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB1P08034 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB1P08034 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB1P08034 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB1P08034 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB1P08034 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB1P08034 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB1P08034 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB1P08034 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB1P08034 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB1P08034 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB1P08034 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB1P08034 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB1P08034 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB1P08034 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB1P08034 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB1P08034 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB1P08034 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB1P08034 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB1P08034 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB1P08034 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB1P08034 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB1P08034 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB1P08034 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB1P08034 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB1P08034 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB1P08034 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB1P08034 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB1P08034 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB1P08034 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB1P08034 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB1P08034 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB1P08034 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB1P08034 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB1P08034 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB1P08034 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB1P08034 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB1P08034 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB1P08034 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB1P08034 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB1P08034 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB1P08034 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB1P08034 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB1P08034 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB1P08034 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB1P08034 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB1P08034 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB1P08034 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB1P08034 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB1P08034 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB1P08034 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB1P08034 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB1P08034 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB1P08034 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB1P08034 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB1P08034 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB1P08034 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB1P08034 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB1P08034 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB1P08034 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB1P08034 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB1P08034 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB1P08034 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB1P08034 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB1P08034 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms