Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEFLP07196 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEFLP07196 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NEFLP07196 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEFLP07196 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEFLP07196 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEFLP07196 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NEFLP07196 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEFLP07196 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEFLP07196 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEFLP07196 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEFLP07196 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEFLP07196 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEFLP07196 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEFLP07196 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEFLP07196 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEFLP07196 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEFLP07196 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEFLP07196 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEFLP07196 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEFLP07196 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEFLP07196 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEFLP07196 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEFLP07196 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEFLP07196 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEFLP07196 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEFLP07196 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEFLP07196 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEFLP07196 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEFLP07196 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEFLP07196 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NEFLP07196 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEFLP07196 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEFLP07196 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NEFLP07196 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEFLP07196 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEFLP07196 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEFLP07196 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEFLP07196 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEFLP07196 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEFLP07196 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEFLP07196 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEFLP07196 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEFLP07196 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEFLP07196 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEFLP07196 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEFLP07196 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEFLP07196 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEFLP07196 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEFLP07196 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEFLP07196 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEFLP07196 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEFLP07196 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NEFLP07196 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEFLP07196 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEFLP07196 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEFLP07196 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NEFLP07196 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEFLP07196 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEFLP07196 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEFLP07196 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEFLP07196 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEFLP07196 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEFLP07196 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEFLP07196 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEFLP07196 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEFLP07196 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEFLP07196 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEFLP07196 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEFLP07196 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEFLP07196 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEFLP07196 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEFLP07196 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEFLP07196 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEFLP07196 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEFLP07196 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEFLP07196 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEFLP07196 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEFLP07196 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEFLP07196 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEFLP07196 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEFLP07196 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEFLP07196 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEFLP07196 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEFLP07196 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEFLP07196 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEFLP07196 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEFLP07196 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEFLP07196 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEFLP07196 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEFLP07196 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEFLP07196 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEFLP07196 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEFLP07196 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEFLP07196 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEFLP07196 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEFLP07196 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEFLP07196 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEFLP07196 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEFLP07196 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms