Protein–RNA interactions for Protein: P07195

LDHB, L-lactate dehydrogenase B chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHBP07195 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LDHBP07195 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LDHBP07195 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LDHBP07195 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LDHBP07195 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LDHBP07195 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LDHBP07195 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LDHBP07195 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LDHBP07195 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LDHBP07195 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LDHBP07195 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LDHBP07195 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LDHBP07195 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LDHBP07195 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LDHBP07195 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LDHBP07195 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LDHBP07195 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LDHBP07195 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LDHBP07195 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LDHBP07195 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LDHBP07195 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LDHBP07195 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LDHBP07195 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LDHBP07195 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LDHBP07195 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LDHBP07195 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LDHBP07195 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LDHBP07195 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LDHBP07195 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LDHBP07195 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LDHBP07195 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LDHBP07195 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LDHBP07195 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LDHBP07195 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LDHBP07195 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LDHBP07195 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LDHBP07195 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LDHBP07195 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LDHBP07195 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LDHBP07195 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LDHBP07195 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LDHBP07195 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LDHBP07195 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LDHBP07195 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LDHBP07195 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LDHBP07195 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LDHBP07195 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LDHBP07195 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LDHBP07195 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LDHBP07195 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LDHBP07195 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LDHBP07195 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LDHBP07195 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LDHBP07195 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LDHBP07195 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LDHBP07195 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LDHBP07195 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LDHBP07195 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LDHBP07195 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LDHBP07195 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LDHBP07195 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LDHBP07195 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LDHBP07195 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LDHBP07195 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LDHBP07195 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LDHBP07195 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LDHBP07195 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LDHBP07195 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LDHBP07195 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LDHBP07195 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LDHBP07195 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LDHBP07195 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LDHBP07195 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LDHBP07195 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LDHBP07195 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LDHBP07195 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LDHBP07195 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LDHBP07195 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LDHBP07195 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LDHBP07195 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LDHBP07195 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LDHBP07195 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LDHBP07195 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LDHBP07195 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LDHBP07195 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LDHBP07195 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LDHBP07195 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LDHBP07195 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LDHBP07195 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LDHBP07195 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LDHBP07195 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LDHBP07195 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LDHBP07195 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LDHBP07195 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LDHBP07195 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LDHBP07195 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LDHBP07195 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LDHBP07195 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LDHBP07195 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LDHBP07195 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms