Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYF2O95926 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYF2O95926 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYF2O95926 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYF2O95926 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYF2O95926 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYF2O95926 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYF2O95926 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYF2O95926 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYF2O95926 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYF2O95926 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYF2O95926 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYF2O95926 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYF2O95926 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SYF2O95926 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYF2O95926 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SYF2O95926 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SYF2O95926 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SYF2O95926 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SYF2O95926 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SYF2O95926 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SYF2O95926 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SYF2O95926 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYF2O95926 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYF2O95926 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYF2O95926 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYF2O95926 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYF2O95926 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYF2O95926 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYF2O95926 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYF2O95926 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYF2O95926 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYF2O95926 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYF2O95926 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYF2O95926 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYF2O95926 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SYF2O95926 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYF2O95926 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYF2O95926 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYF2O95926 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYF2O95926 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYF2O95926 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYF2O95926 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYF2O95926 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYF2O95926 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYF2O95926 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYF2O95926 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYF2O95926 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYF2O95926 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYF2O95926 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYF2O95926 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SYF2O95926 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYF2O95926 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYF2O95926 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYF2O95926 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYF2O95926 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYF2O95926 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYF2O95926 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYF2O95926 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SYF2O95926 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SYF2O95926 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYF2O95926 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYF2O95926 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYF2O95926 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYF2O95926 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYF2O95926 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYF2O95926 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYF2O95926 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SYF2O95926 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYF2O95926 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYF2O95926 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYF2O95926 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYF2O95926 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYF2O95926 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYF2O95926 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYF2O95926 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYF2O95926 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYF2O95926 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYF2O95926 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYF2O95926 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYF2O95926 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYF2O95926 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYF2O95926 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYF2O95926 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYF2O95926 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYF2O95926 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYF2O95926 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYF2O95926 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYF2O95926 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYF2O95926 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYF2O95926 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYF2O95926 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYF2O95926 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYF2O95926 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SYF2O95926 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYF2O95926 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYF2O95926 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYF2O95926 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYF2O95926 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYF2O95926 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms