Protein–RNA interactions for Protein: O95475

SIX6, Homeobox protein SIX6, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX6O95475 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX6O95475 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX6O95475 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX6O95475 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX6O95475 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX6O95475 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX6O95475 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX6O95475 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX6O95475 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX6O95475 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX6O95475 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX6O95475 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX6O95475 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX6O95475 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX6O95475 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX6O95475 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX6O95475 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX6O95475 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX6O95475 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX6O95475 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX6O95475 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX6O95475 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX6O95475 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX6O95475 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX6O95475 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX6O95475 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX6O95475 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX6O95475 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX6O95475 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX6O95475 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX6O95475 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX6O95475 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX6O95475 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX6O95475 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX6O95475 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX6O95475 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX6O95475 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX6O95475 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX6O95475 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX6O95475 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX6O95475 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX6O95475 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX6O95475 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX6O95475 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX6O95475 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX6O95475 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX6O95475 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX6O95475 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX6O95475 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX6O95475 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX6O95475 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX6O95475 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX6O95475 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX6O95475 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX6O95475 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX6O95475 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX6O95475 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX6O95475 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX6O95475 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX6O95475 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX6O95475 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX6O95475 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX6O95475 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX6O95475 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX6O95475 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX6O95475 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX6O95475 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX6O95475 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX6O95475 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX6O95475 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX6O95475 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX6O95475 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX6O95475 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX6O95475 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX6O95475 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX6O95475 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX6O95475 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX6O95475 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX6O95475 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX6O95475 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX6O95475 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX6O95475 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIX6O95475 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIX6O95475 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SIX6O95475 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIX6O95475 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIX6O95475 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIX6O95475 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIX6O95475 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIX6O95475 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SIX6O95475 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIX6O95475 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIX6O95475 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIX6O95475 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIX6O95475 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIX6O95475 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIX6O95475 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIX6O95475 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIX6O95475 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SIX6O95475 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms