Protein–RNA interactions for Protein: O95045

UPP2, Uridine phosphorylase 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP2O95045 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UPP2O95045 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UPP2O95045 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UPP2O95045 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UPP2O95045 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UPP2O95045 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UPP2O95045 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UPP2O95045 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
UPP2O95045 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPP2O95045 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPP2O95045 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPP2O95045 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPP2O95045 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPP2O95045 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPP2O95045 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPP2O95045 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPP2O95045 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPP2O95045 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPP2O95045 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPP2O95045 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPP2O95045 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPP2O95045 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPP2O95045 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPP2O95045 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPP2O95045 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPP2O95045 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
UPP2O95045 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPP2O95045 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPP2O95045 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPP2O95045 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPP2O95045 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPP2O95045 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPP2O95045 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPP2O95045 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPP2O95045 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPP2O95045 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPP2O95045 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPP2O95045 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPP2O95045 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPP2O95045 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPP2O95045 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPP2O95045 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPP2O95045 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPP2O95045 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPP2O95045 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPP2O95045 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPP2O95045 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPP2O95045 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPP2O95045 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPP2O95045 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPP2O95045 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPP2O95045 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPP2O95045 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPP2O95045 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPP2O95045 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPP2O95045 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPP2O95045 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPP2O95045 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPP2O95045 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPP2O95045 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPP2O95045 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPP2O95045 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPP2O95045 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPP2O95045 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPP2O95045 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
UPP2O95045 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPP2O95045 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPP2O95045 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPP2O95045 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPP2O95045 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
UPP2O95045 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPP2O95045 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPP2O95045 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPP2O95045 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPP2O95045 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPP2O95045 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPP2O95045 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPP2O95045 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPP2O95045 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPP2O95045 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPP2O95045 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPP2O95045 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPP2O95045 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPP2O95045 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPP2O95045 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPP2O95045 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPP2O95045 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPP2O95045 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
UPP2O95045 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPP2O95045 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPP2O95045 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPP2O95045 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPP2O95045 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPP2O95045 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPP2O95045 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPP2O95045 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPP2O95045 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPP2O95045 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPP2O95045 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPP2O95045 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 215.1 ms