Protein–RNA interactions for Protein: O75884

RBBP9, Putative hydrolase RBBP9, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP9O75884 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP9O75884 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms