Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
VAMP4O75379 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms