Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms