Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms