Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CXCL13O43927 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms