Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms