Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms