Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms