Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM6BO15054 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KDM6BO15054 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KDM6BO15054 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KDM6BO15054 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
KDM6BO15054 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KDM6BO15054 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
KDM6BO15054 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms