Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PIK3C2AO00443 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms