Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFKBIEO00221 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NFKBIEO00221 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFKBIEO00221 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFKBIEO00221 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFKBIEO00221 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFKBIEO00221 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFKBIEO00221 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NFKBIEO00221 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NFKBIEO00221 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFKBIEO00221 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NFKBIEO00221 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFKBIEO00221 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NFKBIEO00221 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFKBIEO00221 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFKBIEO00221 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFKBIEO00221 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFKBIEO00221 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFKBIEO00221 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NFKBIEO00221 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NFKBIEO00221 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFKBIEO00221 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFKBIEO00221 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFKBIEO00221 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFKBIEO00221 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFKBIEO00221 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFKBIEO00221 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFKBIEO00221 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFKBIEO00221 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NFKBIEO00221 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFKBIEO00221 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFKBIEO00221 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFKBIEO00221 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFKBIEO00221 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFKBIEO00221 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFKBIEO00221 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFKBIEO00221 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFKBIEO00221 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NFKBIEO00221 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFKBIEO00221 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFKBIEO00221 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NFKBIEO00221 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFKBIEO00221 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFKBIEO00221 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms