Protein–RNA interactions for Protein: H3BUK9

POTEB2, POTE ankyrin domain family member B2, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEB2H3BUK9 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POTEB2H3BUK9 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms