Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E9PBE3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E9PBE3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E9PBE3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E9PBE3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E9PBE3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E9PBE3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E9PBE3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
E9PBE3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E9PBE3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E9PBE3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E9PBE3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E9PBE3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E9PBE3 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E9PBE3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E9PBE3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E9PBE3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E9PBE3 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E9PBE3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E9PBE3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E9PBE3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E9PBE3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E9PBE3 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E9PBE3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E9PBE3 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E9PBE3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E9PBE3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
E9PBE3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E9PBE3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E9PBE3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E9PBE3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E9PBE3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E9PBE3 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E9PBE3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E9PBE3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E9PBE3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E9PBE3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E9PBE3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E9PBE3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E9PBE3 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E9PBE3 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
E9PBE3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E9PBE3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E9PBE3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E9PBE3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E9PBE3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E9PBE3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
E9PBE3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E9PBE3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
E9PBE3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E9PBE3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E9PBE3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E9PBE3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E9PBE3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E9PBE3 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E9PBE3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E9PBE3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E9PBE3 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E9PBE3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E9PBE3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E9PBE3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E9PBE3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E9PBE3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E9PBE3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E9PBE3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E9PBE3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E9PBE3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E9PBE3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E9PBE3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E9PBE3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E9PBE3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E9PBE3 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E9PBE3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E9PBE3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E9PBE3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E9PBE3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E9PBE3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E9PBE3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E9PBE3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E9PBE3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E9PBE3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E9PBE3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E9PBE3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E9PBE3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E9PBE3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E9PBE3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E9PBE3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E9PBE3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E9PBE3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
E9PBE3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E9PBE3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E9PBE3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E9PBE3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E9PBE3 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E9PBE3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E9PBE3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E9PBE3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E9PBE3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E9PBE3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E9PBE3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.9 ms