Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms