Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEURL1BA8MQ27 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
NEURL1BA8MQ27 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEURL1BA8MQ27 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEURL1BA8MQ27 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEURL1BA8MQ27 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms