Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYSRT1A8MQ03 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms