Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
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