Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms