Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
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