Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms