Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms