Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms