Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms