Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms