Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FARSAQ9Y285 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms