Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC5Q9UQL6 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC5Q9UQL6 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC5Q9UQL6 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC5Q9UQL6 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC5Q9UQL6 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC5Q9UQL6 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC5Q9UQL6 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC5Q9UQL6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC5Q9UQL6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC5Q9UQL6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC5Q9UQL6 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC5Q9UQL6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC5Q9UQL6 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC5Q9UQL6 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC5Q9UQL6 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC5Q9UQL6 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC5Q9UQL6 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC5Q9UQL6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC5Q9UQL6 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC5Q9UQL6 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC5Q9UQL6 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC5Q9UQL6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC5Q9UQL6 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC5Q9UQL6 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC5Q9UQL6 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC5Q9UQL6 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC5Q9UQL6 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC5Q9UQL6 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC5Q9UQL6 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC5Q9UQL6 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC5Q9UQL6 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC5Q9UQL6 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC5Q9UQL6 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC5Q9UQL6 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC5Q9UQL6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC5Q9UQL6 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC5Q9UQL6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC5Q9UQL6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC5Q9UQL6 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC5Q9UQL6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC5Q9UQL6 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC5Q9UQL6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC5Q9UQL6 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC5Q9UQL6 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC5Q9UQL6 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC5Q9UQL6 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC5Q9UQL6 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC5Q9UQL6 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC5Q9UQL6 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC5Q9UQL6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC5Q9UQL6 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC5Q9UQL6 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC5Q9UQL6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC5Q9UQL6 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC5Q9UQL6 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC5Q9UQL6 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC5Q9UQL6 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HDAC5Q9UQL6 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HDAC5Q9UQL6 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HDAC5Q9UQL6 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HDAC5Q9UQL6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HDAC5Q9UQL6 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC5Q9UQL6 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms