Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IGSF9BQ9UPX0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IGSF9BQ9UPX0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IGSF9BQ9UPX0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IGSF9BQ9UPX0 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IGSF9BQ9UPX0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IGSF9BQ9UPX0 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IGSF9BQ9UPX0 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IGSF9BQ9UPX0 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
IGSF9BQ9UPX0 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IGSF9BQ9UPX0 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
IGSF9BQ9UPX0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
IGSF9BQ9UPX0 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IGSF9BQ9UPX0 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
IGSF9BQ9UPX0 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IGSF9BQ9UPX0 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
IGSF9BQ9UPX0 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
IGSF9BQ9UPX0 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
IGSF9BQ9UPX0 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IGSF9BQ9UPX0 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
IGSF9BQ9UPX0 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IGSF9BQ9UPX0 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
IGSF9BQ9UPX0 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IGSF9BQ9UPX0 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IGSF9BQ9UPX0 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IGSF9BQ9UPX0 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
IGSF9BQ9UPX0 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IGSF9BQ9UPX0 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IGSF9BQ9UPX0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IGSF9BQ9UPX0 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IGSF9BQ9UPX0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IGSF9BQ9UPX0 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IGSF9BQ9UPX0 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
IGSF9BQ9UPX0 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms