Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ9

TNRC6B, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6BQ9UPQ9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNRC6BQ9UPQ9 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNRC6BQ9UPQ9 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TNRC6BQ9UPQ9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNRC6BQ9UPQ9 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNRC6BQ9UPQ9 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNRC6BQ9UPQ9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNRC6BQ9UPQ9 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNRC6BQ9UPQ9 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNRC6BQ9UPQ9 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNRC6BQ9UPQ9 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TNRC6BQ9UPQ9 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNRC6BQ9UPQ9 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNRC6BQ9UPQ9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNRC6BQ9UPQ9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNRC6BQ9UPQ9 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNRC6BQ9UPQ9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNRC6BQ9UPQ9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNRC6BQ9UPQ9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNRC6BQ9UPQ9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNRC6BQ9UPQ9 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNRC6BQ9UPQ9 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNRC6BQ9UPQ9 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNRC6BQ9UPQ9 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNRC6BQ9UPQ9 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNRC6BQ9UPQ9 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNRC6BQ9UPQ9 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNRC6BQ9UPQ9 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNRC6BQ9UPQ9 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNRC6BQ9UPQ9 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNRC6BQ9UPQ9 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNRC6BQ9UPQ9 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNRC6BQ9UPQ9 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNRC6BQ9UPQ9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNRC6BQ9UPQ9 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNRC6BQ9UPQ9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNRC6BQ9UPQ9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNRC6BQ9UPQ9 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNRC6BQ9UPQ9 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNRC6BQ9UPQ9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNRC6BQ9UPQ9 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNRC6BQ9UPQ9 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNRC6BQ9UPQ9 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNRC6BQ9UPQ9 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNRC6BQ9UPQ9 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNRC6BQ9UPQ9 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNRC6BQ9UPQ9 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNRC6BQ9UPQ9 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNRC6BQ9UPQ9 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNRC6BQ9UPQ9 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNRC6BQ9UPQ9 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNRC6BQ9UPQ9 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
TNRC6BQ9UPQ9 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNRC6BQ9UPQ9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNRC6BQ9UPQ9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNRC6BQ9UPQ9 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNRC6BQ9UPQ9 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNRC6BQ9UPQ9 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNRC6BQ9UPQ9 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
TNRC6BQ9UPQ9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNRC6BQ9UPQ9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNRC6BQ9UPQ9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNRC6BQ9UPQ9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNRC6BQ9UPQ9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNRC6BQ9UPQ9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNRC6BQ9UPQ9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNRC6BQ9UPQ9 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNRC6BQ9UPQ9 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNRC6BQ9UPQ9 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNRC6BQ9UPQ9 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNRC6BQ9UPQ9 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNRC6BQ9UPQ9 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNRC6BQ9UPQ9 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNRC6BQ9UPQ9 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNRC6BQ9UPQ9 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNRC6BQ9UPQ9 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TNRC6BQ9UPQ9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNRC6BQ9UPQ9 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNRC6BQ9UPQ9 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TNRC6BQ9UPQ9 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNRC6BQ9UPQ9 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNRC6BQ9UPQ9 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNRC6BQ9UPQ9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNRC6BQ9UPQ9 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNRC6BQ9UPQ9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNRC6BQ9UPQ9 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TNRC6BQ9UPQ9 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNRC6BQ9UPQ9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNRC6BQ9UPQ9 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNRC6BQ9UPQ9 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TNRC6BQ9UPQ9 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TNRC6BQ9UPQ9 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TNRC6BQ9UPQ9 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TNRC6BQ9UPQ9 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNRC6BQ9UPQ9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNRC6BQ9UPQ9 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms