Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SCML1Q9UN30 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms