Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC9Q9UKV0 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms