Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ3

GPATCH8, G patch domain-containing protein 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPATCH8Q9UKJ3 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GPATCH8Q9UKJ3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GPATCH8Q9UKJ3 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GPATCH8Q9UKJ3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GPATCH8Q9UKJ3 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GPATCH8Q9UKJ3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GPATCH8Q9UKJ3 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
GPATCH8Q9UKJ3 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GPATCH8Q9UKJ3 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
GPATCH8Q9UKJ3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
GPATCH8Q9UKJ3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GPATCH8Q9UKJ3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GPATCH8Q9UKJ3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GPATCH8Q9UKJ3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GPATCH8Q9UKJ3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GPATCH8Q9UKJ3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GPATCH8Q9UKJ3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GPATCH8Q9UKJ3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPATCH8Q9UKJ3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPATCH8Q9UKJ3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPATCH8Q9UKJ3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPATCH8Q9UKJ3 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
GPATCH8Q9UKJ3 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPATCH8Q9UKJ3 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPATCH8Q9UKJ3 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPATCH8Q9UKJ3 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
GPATCH8Q9UKJ3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPATCH8Q9UKJ3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPATCH8Q9UKJ3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPATCH8Q9UKJ3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPATCH8Q9UKJ3 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPATCH8Q9UKJ3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPATCH8Q9UKJ3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GPATCH8Q9UKJ3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GPATCH8Q9UKJ3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GPATCH8Q9UKJ3 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GPATCH8Q9UKJ3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GPATCH8Q9UKJ3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GPATCH8Q9UKJ3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GPATCH8Q9UKJ3 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GPATCH8Q9UKJ3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GPATCH8Q9UKJ3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GPATCH8Q9UKJ3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GPATCH8Q9UKJ3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GPATCH8Q9UKJ3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GPATCH8Q9UKJ3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
GPATCH8Q9UKJ3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GPATCH8Q9UKJ3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GPATCH8Q9UKJ3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GPATCH8Q9UKJ3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GPATCH8Q9UKJ3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GPATCH8Q9UKJ3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
GPATCH8Q9UKJ3 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
GPATCH8Q9UKJ3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
GPATCH8Q9UKJ3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.08
GPATCH8Q9UKJ3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.08
GPATCH8Q9UKJ3 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
GPATCH8Q9UKJ3 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
GPATCH8Q9UKJ3 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
GPATCH8Q9UKJ3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
GPATCH8Q9UKJ3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GPATCH8Q9UKJ3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
GPATCH8Q9UKJ3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GPATCH8Q9UKJ3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GPATCH8Q9UKJ3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GPATCH8Q9UKJ3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
GPATCH8Q9UKJ3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GPATCH8Q9UKJ3 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GPATCH8Q9UKJ3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GPATCH8Q9UKJ3 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GPATCH8Q9UKJ3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GPATCH8Q9UKJ3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GPATCH8Q9UKJ3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GPATCH8Q9UKJ3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GPATCH8Q9UKJ3 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GPATCH8Q9UKJ3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GPATCH8Q9UKJ3 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
GPATCH8Q9UKJ3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GPATCH8Q9UKJ3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GPATCH8Q9UKJ3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GPATCH8Q9UKJ3 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
GPATCH8Q9UKJ3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GPATCH8Q9UKJ3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GPATCH8Q9UKJ3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GPATCH8Q9UKJ3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GPATCH8Q9UKJ3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GPATCH8Q9UKJ3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GPATCH8Q9UKJ3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GPATCH8Q9UKJ3 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GPATCH8Q9UKJ3 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GPATCH8Q9UKJ3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GPATCH8Q9UKJ3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GPATCH8Q9UKJ3 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GPATCH8Q9UKJ3 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GPATCH8Q9UKJ3 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
GPATCH8Q9UKJ3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GPATCH8Q9UKJ3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GPATCH8Q9UKJ3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GPATCH8Q9UKJ3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GPATCH8Q9UKJ3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms