Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNL1Q9UK58 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNL1Q9UK58 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNL1Q9UK58 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms