Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms