Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCN11AQ9UI33 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms