Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.29■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.29■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.28■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.27■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.27■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
USP25Q9UHP3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms