Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CPNE7Q9UBL6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms