Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE8

NLK, Serine/threonine-protein kinase NLK, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLKQ9UBE8 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NLKQ9UBE8 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms