Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms