Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms